Hola Yando, dices que se mezcla el refrigerante con el aceite de la caja automática y das por hecho que la caja está mal, pero eso no tiene por que ser así.
Lo que tienes mal, seguramente, es el intercambiador de calor (radiador) que enfria el aceite de la caja, que estara roto en algún sitio y mezcla los dos fluidos.
Yo supongo que la solucion será cambiar el radiador (o repararlo) y cambiar el aceite de la caja un par de veces para que se limpie bien si ha tenido refrigerante dentro.
Si es un T6 creo que habria que cambiarle tambien el filtro que lleva la propia caja, pero esta no tiene por que estar mal, salvo que ya estuviera tocada o que haya funcionado mucho tiempo con el refrigerante dentro.
En cualquier caso, eso parece una reparación para un taller especializado en cajas automáticas.